Когда выделение выполнено, его можно сохранить с помощью команды Edit->SelectPush->Selection. Выделение при этом не изменится, но сохранится в стеке. Для того, чтобы восстановить этот выделенный набор позднее, используйте команду Pop Selection.

Есть некоторое настройки выбора, которые можно установить с помощью настроек "Selection" (меню File->Preferences ..., раздел "General", вкладка "Selection"). "Easy selection" управляет возможностью выбора объектов простым кликом, либо с помощью дополнительных действий. Вы можете указать чтобы все отдельные ячейки и весь текст аннотации были немедленно выбраны. (см. следующий раздел)..
Установка "Dragging must enclose entire object " требует, чтобы область выбора полностью включала объект. По умолчанию выбирается любой объект касающийся области.
Для предотвращения случайного перемещения объекта после выбора, его перемещение блокируется в течение короткого интервала времени после щелчка. Этой задержкой также можно управлять. 
Когда курсор перемещается по схеме, подсвечивается то, что будет выбрано при следующем клике. Усовершенствованный предварительный просмотр показывает в различных цветах что фактически выделено (по умолчанию это синий, но это можно изменить параметром "Color", см. раздел 4.6.2). Эта особенность называется "mouse-over highlighting". Если вам не нужен предпросмотр, отключите опцию "Enable mouse-over highlighting".
Если узел выбран, то выбрана и вся подключенная к нему схема. Чтобы запретить это, снимите установленную галочку в пункте "Highlight Connected Objects".
Когда слои, узлы или дуги невидимы их выбрать невозможно. Чтобы позволить невидимым узлам и дугам стать выбираемыми, измените параметр "Can select objects whose layers are invisible" (см. раздел 4.5.3 для подробностей о видимости слоев).